Может ли исполнитель выставить все затраты одним актом?

Прямого запрета на совершение этих действий нет. Вы вправе оформить это и таким образом. В рассматриваемом случае определяющего значения каким образом это будет оформлено не имеется. Главное, чтобы в этом акте чётко были прописаны работы, которые были оказаны, чтобы всем было понятно, какие именно виды работ и за какие периоды включены в единый документ, чтобы потом на этот счёт не возникло вопросов и не возникло двусмысленных толкований.